مرکز پزشکی آموزشی و درمانی شهید مدرس از سال ۱۳۵۴ توسط سازمان برنامه تجهیز و به دانشکده پزشکی دانشگاه ملی ایران واگذار گردید که در ابتدای تاسیس بیمارستان با بخشهای قلب و عروق هماتولوژی، جراحی عمومی،ارولوژی،دیالیز ،نفرولوژی ،جراحی قلب،بیهوشی وبخشهای پاراکلینکی شروع به کار نمود.